Ny fase af pandemien: farlig stamme "Delta"

2024 Forfatter: Seth Attwood | [email protected]. Sidst ændret: 2023-12-16 16:01

Den nye indiske stamme covid-19, som allerede er navngivet af forskerne "Delta", har affødt den tredje bølge af pandemien i mange lande. I selve New Delhi er situationen ganske enkelt katastrofal - 30.000 tilfælde om dagen. Institutterne begyndte at studere "Deltaen" og slog straks alarm.

Den nye stamme viste sig ikke kun at være mere smitsom, men også mindre sårbar over for antistoffer. Det betyder, at han med succes kan modstå de "modangreb", som vores immunsystem vil føre mod ham.

Da varianten af coronavirus, nu døbt "Delta", først dukkede op i den indiske delstat Maharashtra i december 2020, så det ikke ud til at være noget særligt. Men da det ramte New Delhi et par måneder senere, var konsekvenserne mest ødelæggende, med næsten 30.000 tilfælde hver dag i slutningen af april. "Pludselig begyndte han at dominere og fuldstændig knuste Alpha-stammen, som indtil da var den mest udbredte i byen," siger Anurag Agrawal, leder af Institute of Genome and Integrative Biology i New Delhi.

New Delhi syntes usandsynligt at stå over for endnu et større udbrud, sagde Agrawal, da mange af dets indbyggere enten var syge eller vaccinerede. Men det viste sig, at disse forsvarsmidler mod Delta er magtesløse. Den er mere smitsom og undslipper immunforsvaret, siger han: "Den tre meter lange mur rundt om byen ser ud til at være blevet til en halv meter, som det ikke er svært at træde over."

Fra New Delhi har stammen spredt sig hurtigt og ser nu ud til at feje over kloden med en ny, ødelæggende bølge. I Storbritannien står Delta allerede for mere end 90 % af nye tilfælde: Dette har fået antallet af tilfælde af coronavirus til at stige igen efter et kraftigt fald, og i sidste uge måtte regeringen endda udskyde den sidste fase af sin plan for grænseåbning.. Udbruddet af deltaet i Lissabon tvang den portugisiske regering til at indføre et tre-dages rejseforbud mellem hovedstaden og resten af landet.

Ved udgangen af august vil denne mulighed stå for op til 90 % af alle tilfælde af coronavirus i EU, advarede lederen af det europæiske center for sygdomsforebyggelse og kontrol Andrea Ammon i dag. "Det er meget sandsynligt, at Delta-stammen vil sprede sig meget i løbet af sommeren, især blandt unge mennesker, der ikke er en del af vaccinationsprogrammet," sagde hun. "Dette kan sætte flere sårbare borgere i risiko for at blive alvorligt syge eller endda døde. hvis de ikke er fuldt vaccineret."

Delta-løbene er blevet registreret i Rusland, Indonesien og mange andre lande. I USA, hvor forekomsten af stammen anslås til at være mindst 14%, sagde CDC den 15. juni, at det var "af største bekymring."

Opsvinget har udløst en række undersøgelser for at forstå, hvorfor Delta spreder sig meget hurtigere end de tre andre bekymrende varianter, hvis det ellers er mere farligt, og hvordan dets unikke sæt af mutationer, der forårsager ændringer i proteinmiljøet, kan forårsage alvorlig skade. Ankomsten af Delta fremhævede, at SARS-CoV-2-virussen kan tilpasse sig og udvikle sig i løbet af de kommende måneder og år.

I øjeblikket udgør Delta en særlig trussel mod de fattigste lande, hvis adgang til vacciner er begrænset eller fuldstændig fraværende, siger Sumya Shwaminathan, videnskabelig chefrådgiver for Verdenssundhedsorganisationen. "Det, der bekymrer mig mest, er, hvad der vil ske, når Delta kommer til Afrika," siger hun.

En undersøgelse fra Public Health England har fremhævet spredningspotentialet af Delta. Sammenlignet med Alpha, som blev lanceret i Storbritannien i 2020, "har vi 50 % eller 100 % flere transmissioner," siger Adam Kucharski, en modeludvikler ved London School of Hygiene and Tropical Medicine.

Men Kuharsky siger også, at faldet i beskyttelsen mod vacciner kunne have påvirket. Pfizer-BioNTech- og AstraZeneca-vacciner giver lidt mindre beskyttelse mod symptomatiske infektioner med den nye variant end for Alpha-stammen, baseret på data fra England og Skotland. Mennesker med kun et skud er særligt sårbare - ligesom mange i Storbritannien. (To doser af enhver vaccine vil stadig give det samme høje niveau af beskyttelse mod hospitalsindlæggelse, selv mod Delta.) Hvor godt andre vacciner, der bruges rundt om i verden, beskytter, er uklart, og der er få beviser for beskyttelse hos dem, der er kommet sig over tidligere bølger af coronavirus.

Begge disse effekter - øget transmission og unddragelse af immunitet - er svære at adskille fra hinanden, men lederen af Wellcome Trust, Jeremy Farrar, mener, at transmissionen er bag Delta-springet, ikke immunitetsbypass. "Hvis Alpha er omkring 50 % mere overførbar end den naturlige stamme, og Delta er yderligere 50 %, så taler vi om en virus, der er dobbelt så overførbar end den oprindelige stamme," forklarer en evolutionær virolog fra Oxford Aris Katzourakis University.

Dette vil betyde, at lande og befolkninger med lave vaccinationsrater kan stå over for store nye udbrud. "Hvis den hurtigere spredning udelukkende skyldes virussens fundament, så er dette katastrofale nyheder for resten af verden," siger Kuharski.

Oven i det er det mere sandsynligt, at Delta sender uvaccinerede borgere på hospitalet end Alpha. Tidlige data fra Storbritannien tyder på, at risikoen for hospitalsindlæggelse kan være dobbelt så høj. Tilsammen kan disse egenskaber forårsage enorme problemer i Afrika, sagde Schwaminathan. "Der vil ikke være ilt, der vil ikke være nok hospitalssenge. Og vi ved allerede, at hospitalsresultaterne i Afrika er værre end i andre lande, siger hun. "Så det kan virkelig føre til højere dødelighed selv blandt unge."

Mutationer interfererer med antistoffer

Forskere er lige begyndt at finde ud af, hvorfor Delta er så farligt. De fokuserede på et sæt af ni mutationer i et gen, der koder for et spidsprotein, der sonderer overfladen og tillader virussen at trænge ind i menneskelige celler. En vigtig mutation, kaldet P681R, ændrer en aminosyre lige ved siden af furin-spaltningsstedet, hvor et humant enzym spalter proteinet - et nøgletrin, der tillader virussen at trænge ind i menneskelige celler.

I Alpha-stammen gjorde denne mutation spaltningen mere effektiv. Ifølge en foreløbig publikation i slutningen af maj gør Delta-mutationer det endnu nemmere for furin at nedbryde. Forskerne spekulerer i, at dette også kan øge overførbarheden af virussen.

Japanske forskere, der skabte pseudovirus med samme mutation, bekræftede dog ikke den øgede smitteevne under laboratorieforhold, og i Indien viste andre varianter af coronavirus med samme mutation sig at være meget mindre smitsomme end Delta, siger evolutionær virolog ved universitetet af Edinburgh, Andrew Rambaut). "Så der skal være interaktion med noget andet i genomet."

Andre Delta-mutationer kan hjælpe med at underminere immuniteten. Nogle af dem ændrer det N-terminale domæne af rygsøjlen (NTD), der rager ud fra overfladen af proteinet. I en nylig artikel i tidsskriftet Cell blev det afsløret, at et af NTD-pletterne, kaldet "super-site", uvægerligt retter sig mod "superpotente" neutraliserende antistoffer fra helbredte patienter. De unikke Delta-mutationer fjerner aminosyrer i position 156 og 157 af "superfrekvensen" og ændrer aminosyre 158 fra arginin til glycin - sidstnævnte eliminerer det direkte kontaktpunkt for antistofbinding, forklarer strukturbiolog David Ostrov fra University of Florida.

"Vi mener, at 157/158-mutationen er en af de karakteristiske Delta-mutationer, der gav stammen denne immunitetunddragelsesfænotype," er enig Trevor Bedford, en computerbiolog ved Fred Hutchinson Cancer Research Center.

En anden mutation i NTD-superregionen kan også bekæmpe antistoffer. Og forskere bør begynde at studere betydningen af ændringer i andre Delta-proteiner, siger Nevan Krogan, en molekylærbiolog ved University of California, San Francisco. "Der er meget, vi ikke ved om disse muligheder på alle niveauer. Vi ser ud til at vandrer i mørket." For eksempel har "Delta" adskillige mutationer i nukleocapsidproteinet, som udfører mange funktioner "som en schweizisk hærkniv," forklarer virolog David Bauer fra Francis Crick Institute. Det vil dog tage måneder at eksperimentere at afklare.

Accelereret vaccination

I mellemtiden er videnskabsmænd enige: Der er behov for en hurtig handling for at stoppe spredningen af den nye variant. "Delta-bekymringer burde motivere os til virkelig at fremskynde vaccination og øge vaccinetilgængeligheden i det felt, hvor Delta vinder frem," sagde virolog Angela Rasmussen fra University of Saskatchewan. USA's præsident Joe Biden har opfordret amerikanerne til at få en fuld vaccination for at beskytte sig mod Delta. Ammon opfordrede i dag europæiske lande til at fremskynde planerne om fuldt ud at vaccinere sårbare befolkningsgrupper.

Derudover, sagde hun, er det nødvendigt at opretholde restriktioner, så den nye mulighed ikke spreder sig og medfører en ny stigning i sygelighed, hospitalsindlæggelser og dødsfald. Lande med begrænset adgang til vacciner er nødt til at vende tilbage til foranstaltninger som fysisk afstand og masker, sagde Rasmussen. Og i Europa opfordrede Ammon landene til at gøre begge dele: opretholde restriktioner, mens de arbejder på at vaccinere udsatte befolkningsgrupper fuldt ud.

Målet er ikke kun at redde liv, men også at forhindre den videre udvikling af virussen. Spredningen af Delta har vist, at videnskabsmænd ikke er i stand til at genkende farlige nye varianter i tide til at stoppe deres spredning, siger Emma Hodcroft, en virolog ved University of Basel, på trods af hidtil usete globale bestræbelser på at spore deres udvikling i realtid. Det ville være farligt at antage, at SARS-CoV-2 ville stoppe der, sagde Katsurakis. "Alt i evolutionen, der er sket mindst to gange, er allerede et mønster," siger han. "Jeg ville ikke blive overrasket, hvis vi ser lignende ændringer i det næste år eller to."